Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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SEC23BQ15437 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC23BQ15437 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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SEC23BQ15437 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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SEC23BQ15437 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SEC23BQ15437 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SEC23BQ15437 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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SEC23BQ15437 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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SEC23BQ15437 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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SEC23BQ15437 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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