Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF4Q15306 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms