Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABEP1Q15276 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
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