Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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