Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EXOSC7Q15024 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC7Q15024 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC7Q15024 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC7Q15024 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC7Q15024 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC7Q15024 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC7Q15024 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC7Q15024 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC7Q15024 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC7Q15024 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC7Q15024 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC7Q15024 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC7Q15024 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC7Q15024 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC7Q15024 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC7Q15024 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC7Q15024 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms