Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD6Q15008 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms