Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PCLAFQ15004 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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