Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME4Q14997 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
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