Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
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COL19A1Q14993 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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COL19A1Q14993 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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COL19A1Q14993 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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COL19A1Q14993 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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COL19A1Q14993 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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