Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERV3-1Q14264 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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ERV3-1Q14264 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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ERV3-1Q14264 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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ERV3-1Q14264 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
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ERV3-1Q14264 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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ERV3-1Q14264 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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ERV3-1Q14264 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERV3-1Q14264 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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