Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBI3Q14213 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBI3Q14213 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms