Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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