Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIDRQ14159 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms