Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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