Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGB1Q14028 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
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