Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX2Q13950 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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