Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXOSC2Q13868 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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