Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SHROOM2Q13796 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
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SHROOM2Q13796 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
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SHROOM2Q13796 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
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SHROOM2Q13796 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
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SHROOM2Q13796 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
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SHROOM2Q13796 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
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SHROOM2Q13796 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
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SHROOM2Q13796 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
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