Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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