Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR4Q13639 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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HTR4Q13639 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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HTR4Q13639 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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HTR4Q13639 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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HTR4Q13639 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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HTR4Q13639 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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