Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
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