Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCIRG1Q13488 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
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