Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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