Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3B2Q13367 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
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