Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDRQ13258 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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