Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF5Q13243 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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