Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms