Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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