Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
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