Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC16Q13042 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC16Q13042 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
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