Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PRDM2Q13029 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
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