Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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