Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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