Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC10A2Q12908 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC10A2Q12908 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms