Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STX4Q12846 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STX4Q12846 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
STX4Q12846 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
STX4Q12846 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
STX4Q12846 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
STX4Q12846 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
STX4Q12846 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
STX4Q12846 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
STX4Q12846 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STX4Q12846 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STX4Q12846 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STX4Q12846 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STX4Q12846 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STX4Q12846 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STX4Q12846 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STX4Q12846 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STX4Q12846 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STX4Q12846 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STX4Q12846 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STX4Q12846 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STX4Q12846 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STX4Q12846 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STX4Q12846 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STX4Q12846 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STX4Q12846 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STX4Q12846 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
STX4Q12846 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STX4Q12846 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STX4Q12846 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STX4Q12846 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STX4Q12846 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STX4Q12846 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STX4Q12846 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STX4Q12846 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STX4Q12846 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STX4Q12846 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STX4Q12846 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STX4Q12846 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STX4Q12846 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STX4Q12846 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STX4Q12846 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STX4Q12846 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STX4Q12846 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STX4Q12846 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
STX4Q12846 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
STX4Q12846 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
STX4Q12846 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STX4Q12846 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
STX4Q12846 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
STX4Q12846 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STX4Q12846 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
STX4Q12846 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
STX4Q12846 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STX4Q12846 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STX4Q12846 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STX4Q12846 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
STX4Q12846 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STX4Q12846 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STX4Q12846 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
STX4Q12846 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
STX4Q12846 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STX4Q12846 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
STX4Q12846 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
STX4Q12846 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STX4Q12846 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
STX4Q12846 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STX4Q12846 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
STX4Q12846 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STX4Q12846 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STX4Q12846 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STX4Q12846 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STX4Q12846 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
STX4Q12846 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
STX4Q12846 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
STX4Q12846 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms