Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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RAB40BQ12829 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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RAB40BQ12829 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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RAB40BQ12829 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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RAB40BQ12829 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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RAB40BQ12829 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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RAB40BQ12829 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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RAB40BQ12829 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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RAB40BQ12829 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB40BQ12829 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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