Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFEMP1Q12805 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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