Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
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