Protein–RNA interactions for Protein: Q12756

KIF1A, Kinesin-like protein KIF1A, humanhuman

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1AQ12756 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
KIF1AQ12756 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF1AQ12756 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms