Protein–RNA interactions for Protein: Q12060

HFI1, Transcriptional coactivator HFI1/ADA1, yeastyeast

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HFI1Q12060 VPS64YDR200C 1815 nt3.07□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 TIM11YDR322C-A 291 nt3.07□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 BSC3YLR465C 309 nt3.07□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 RPS7BYNL096C 573 nt3.07□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 ERP4YOR016C 624 nt3.07□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 YPR039WYPR039W 336 nt3.07□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 DSE4YNR067C 3354 nt3.06□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 SDH7YDR511W 402 nt3.06□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 HPA3YEL066W 540 nt3.06□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 YER188C-AYER188C-A 300 nt3.06□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 YER189WYER189W 369 nt3.06□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 YIL054WYIL054W 318 nt3.06□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 YIL058WYIL058W 285 nt3.06□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 YIL166CYIL166C 1629 nt3.06□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 PSK1YAL017W 4071 nt3.06□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.06□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 BNA4YBL098W 1383 nt3.06□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 RPL33AYPL143W 324 nt3.06□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 BPT1YLL015W 4680 nt3.05□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 SPO71YDR104C 3738 nt3.05□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 DOA4YDR069C 2781 nt3.05□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 ADK1YDR226W 669 nt3.05□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 TIM8YJR135W-A 264 nt3.05□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 ITC1YGL133W 3795 nt3.05□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 YSW1YBR148W 1830 nt3.05□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 PSY2YNL201C 2577 nt3.04□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 snR70snR70 164 nt3.04□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 AST2YER101C 1293 nt3.04□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 DLS1YJL065C 504 nt3.04□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 YPL185WYPL185W 396 nt3.04□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 YPR197CYPR197C 564 nt3.04□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 GPI8YDR331W 1236 nt3.03□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt3.03□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 RCY1YJL204C 2523 nt3.03□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 PUF4YGL014W 2667 nt3.03□□□□□ -1.92
HFI1Q12060 YHR078WYHR078W 1659 nt3.02□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 TSC11YER093C 4293 nt3.02□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 RGR1YLR071C 3249 nt3.02□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt3.02□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 RPS24BYIL069C 408 nt3.02□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YML037CYML037C 1023 nt3.02□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 AIM32YML050W 936 nt3.02□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YBL065WYBL065W 345 nt3.02□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 BAS1YKR099W 2436 nt3.02□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 RPN1YHR027C 2982 nt3.02□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 TAF2YCR042C 4224 nt3.01□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 SNX41YDR425W 1878 nt3.01□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 ECM25YJL201W 1800 nt3.01□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 CAJ1YER048C 1176 nt3.01□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 PET191YJR034W 327 nt3.01□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YKR033CYKR033C 426 nt3.01□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 JIP3YLR331C 378 nt3.01□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt3.01□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 SSE1YPL106C 2082 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YER138CYER138C 5268 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YER160CYER160C 5268 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YJR027WYJR027W 5268 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YML039WYML039W 5268 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YML045WYML045W 5268 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YMR050CYMR050C 5268 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 PMR1YGL167C 2853 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 HYR1YIR037W 492 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YLR434CYLR434C 384 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 GYP7YDL234C 2241 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 NPR3YHL023C 3441 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 DIE2YGR227W 1578 nt3□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 TAO3YIL129C 7131 nt2.99□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.99□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YJR011CYJR011C 786 nt2.99□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 SEC22YLR268W 645 nt2.99□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YOR105WYOR105W 327 nt2.99□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 BRO1YPL084W 2535 nt2.99□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 GCD10YNL062C 1437 nt2.99□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 MKT1YNL085W 2493 nt2.99□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YPK1YKL126W 2043 nt2.98□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 RRM3YHR031C 2172 nt2.98□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 GNT1YOR320C 1476 nt2.98□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 SGS1YMR190C 4344 nt2.98□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YDL068WYDL068W 330 nt2.98□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 ICY1YMR195W 384 nt2.98□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YJL016WYJL016W 1686 nt2.98□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 SPC72YAL047C 1869 nt2.97□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 snR76snR76 109 nt2.97□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 YML003WYML003W 873 nt2.97□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 MRPL50YNR022C 420 nt2.97□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 TRM7YBR061C 933 nt2.97□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 ATP15YPL271W 189 nt2.97□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 PSO2YMR137C 1986 nt2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58.7 ms