Protein–RNA interactions for Protein: Q12018

CDC53, Cell division control protein 53, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CDC53Q12018 MMS22YLR320W 4365 nt3.39□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 GCN1YGL195W 8019 nt3.39□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 GCD10YNL062C 1437 nt3.39□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 YDL068WYDL068W 330 nt3.39□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 snR76snR76 109 nt3.39□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 APC9YLR102C 798 nt3.39□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 YDL180WYDL180W 1644 nt3.39□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 YOR146WYOR146W 306 nt3.38□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 YPR197CYPR197C 564 nt3.38□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 YJL016WYJL016W 1686 nt3.38□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 YPK1YKL126W 2043 nt3.37□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt3.37□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 RGM1YMR182C 636 nt3.37□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 PSK2YOL045W 3306 nt3.36□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 TPS2YDR074W 2691 nt3.36□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.36□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.36□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt3.36□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 MSB2YGR014W 3921 nt3.36□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 NUP120YKL057C 3114 nt3.35□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 PUF6YDR496C 1971 nt3.35□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 RPS20YHL015W 366 nt3.35□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 DLS1YJL065C 504 nt3.35□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 NCE101YJL205C 162 nt3.35□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 TRM7YBR061C 933 nt3.35□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 NUP82YJL061W 2142 nt3.35□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 YHR080CYHR080C 4038 nt3.34□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 RPL40AYIL148W 387 nt3.34□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 RAM2YKL019W 951 nt3.34□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 YOR121CYOR121C 306 nt3.34□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt3.34□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 YBR197CYBR197C 654 nt3.34□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 DBP10YDL031W 2988 nt3.34□□□□□ -1.87
CDC53Q12018 SSN2YDR443C 4263 nt3.34□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 CSR2YPR030W 3366 nt3.34□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 SNX41YDR425W 1878 nt3.33□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 AAD16YFL057C 459 nt3.33□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 RGA2YDR379W 3030 nt3.33□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 SIN3YOL004W 4611 nt3.33□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 ITC1YGL133W 3795 nt3.33□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 DNL4YOR005C 2835 nt3.33□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 YSP2YDR326C 4317 nt3.32□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 ASG1YIL130W 2895 nt3.32□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 YLR012CYLR012C 300 nt3.32□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 COA4YLR218C 453 nt3.32□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt3.32□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 YJL181WYJL181W 1836 nt3.32□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 SKT5YBL061C 2091 nt3.32□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 CIN8YEL061C 3003 nt3.32□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 RPN1YHR027C 2982 nt3.31□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 YML003WYML003W 873 nt3.31□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 PRE8YML092C 753 nt3.31□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 SAK1YER129W 3429 nt3.31□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 DUG2YBR281C 2637 nt3.3□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 NET1YJL076W 3570 nt3.3□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 ECM21YBL101C 3354 nt3.3□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 YDL041WYDL041W 354 nt3.3□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 YGR035CYGR035C 351 nt3.3□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 RNP1YLL046C 750 nt3.3□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 RPS22BYLR367W 393 nt3.3□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 ATP15YPL271W 189 nt3.3□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 ROG1YGL144C 2058 nt3.3□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 VPS52YDR484W 1926 nt3.3□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 FIR1YER032W 2631 nt3.3□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 NFT1YKR103W 3657 nt3.3□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 YEL057CYEL057C 702 nt3.29□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt3.29□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 YPL238CYPL238C 390 nt3.29□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 NMD2YHR077C 3270 nt3.29□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 BUD4YJR092W 4344 nt3.29□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 YPP1YGR198W 2454 nt3.29□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 YPL216WYPL216W 3309 nt3.28□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 RCY1YJL204C 2523 nt3.28□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 CCW14YLR390W-A 717 nt3.28□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 FPR1YNL135C 345 nt3.28□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 GCV2YMR189W 3105 nt3.28□□□□□ -1.88
CDC53Q12018 SNQ2YDR011W 4506 nt3.27□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 SPO14YKR031C 5052 nt3.27□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 CHS2YBR038W 2892 nt3.27□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 SDC25YLL016W 3147 nt3.27□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 DOA4YDR069C 2781 nt3.27□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 URM1YIL008W 300 nt3.27□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 YJR011CYJR011C 786 nt3.27□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 ROX1YPR065W 1107 nt3.27□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 ORC1YML065W 2745 nt3.27□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 MSL5YLR116W 1431 nt3.27□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 RPA190YOR341W 4995 nt3.27□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 COX1Q0045 1605 nt3.26□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 DYN1YKR054C 12279 nt3.26□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 DBP7YKR024C 2229 nt3.26□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt3.26□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 YER137W-AYER137W-A 306 nt3.26□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.26□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 CRS5YOR031W 210 nt3.26□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 RIF1YBR275C 5751 nt3.26□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 SPO71YDR104C 3738 nt3.26□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 TLC1TLC1 1301 nt3.25□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 MET6YER091C 2304 nt3.25□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 POL2YNL262W 6669 nt3.25□□□□□ -1.89
CDC53Q12018 RTT102YGR275W 474 nt3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.6 ms