Protein–RNA interactions for Protein: Q12009

TRM8, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM8Q12009 YFL019CYFL019C 354 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 RAM2YKL019W 951 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 RPL36AYMR194W 303 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 YOR105WYOR105W 327 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 RLI1YDR091C 1827 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 TOM1YDR457W 9807 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 ESL2YKR096W 3588 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 YJR157WYJR157W 363 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 YLR458WYLR458W 381 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 AIM32YML050W 936 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 SIP18YMR175W 240 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 MRPL33YMR286W 261 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 RPL25YOL127W 429 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 snR41snR41 95 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 SLM6YBR266C 453 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 YHR078WYHR078W 1659 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 HOS4YIL112W 3252 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 SEC7YDR170C 6030 nt2.65□□□□□ -1.98
TRM8Q12009 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.65□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.65□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 ACM1YPL267W 630 nt2.65□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 NUM1YDR150W 8247 nt2.65□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 HRD3YLR207W 2502 nt2.65□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YGR067CYGR067C 2415 nt2.64□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 UBP15YMR304W 3693 nt2.64□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 SIR3YLR442C 2937 nt2.64□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 AAD16YFL057C 459 nt2.64□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YGL165CYGL165C 579 nt2.64□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YGR042WYGR042W 816 nt2.64□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YJR079WYJR079W 330 nt2.64□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 AIM29YKR074W 468 nt2.64□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 JIP3YLR331C 378 nt2.64□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 TOM22YNL131W 459 nt2.64□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 AYT1YLL063C 1425 nt2.64□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 MUD2YKL074C 1584 nt2.64□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 INP53YOR109W 3324 nt2.63□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YPK1YKL126W 2043 nt2.63□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 VPS16YPL045W 2397 nt2.63□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 TIM8YJR135W-A 264 nt2.63□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 RPS1AYLR441C 768 nt2.63□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 RPB5YBR154C 648 nt2.63□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YDR186CYDR186C 2634 nt2.63□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 ASG1YIL130W 2895 nt2.63□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 BCK1YJL095W 4437 nt2.62□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 SMY2YBR172C 2223 nt2.62□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 PTC5YOR090C 1719 nt2.62□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YPL150WYPL150W 2706 nt2.62□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.62□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.62□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YDL068WYDL068W 330 nt2.62□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 GET1YGL020C 708 nt2.62□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YIL174WYIL174W 228 nt2.62□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.62□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.62□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 SEN15YMR059W 387 nt2.62□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.62□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 ICY1YMR195W 384 nt2.62□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 RPS7BYNL096C 573 nt2.62□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YPR177CYPR177C 372 nt2.62□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 SWA2YDR320C 2007 nt2.62□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 RTT10YPL183C 3042 nt2.62□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 GDS1YOR355W 1569 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 GIS1YDR096W 2685 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 ACB1YGR037C 264 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YGR050CYGR050C 357 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 RPS22AYJL190C 393 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YAR068WYAR068W 486 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 RPS29AYLR388W 171 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 PRM3YPL192C 402 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 RGA2YDR379W 3030 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 ECM29YHL030W 5607 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 NAB6YML117W 3405 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 HSC82YMR186W 2118 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 UBP11YKR098C 2154 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 TOP2YNL088W 4287 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 CYR1YJL005W 6081 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 RPL14BYHL001W 417 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 NBL1YHR199C-A 222 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 RRT1YBL048W 312 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YOR248WYOR248W 303 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 INP51YIL002C 2841 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YNL018CYNL018C 1839 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 RNH70YGR276C 1662 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YEL043WYEL043W 2871 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YCR064CYCR064C 411 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 FMP16YDR070C 282 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 SDC1YDR469W 528 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YFR056CYFR056C 369 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 RPL40AYIL148W 387 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM8Q12009 YNL010WYNL010W 726 nt2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.3 ms