Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms