Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms