Protein–RNA interactions for Protein: Q08968

FMP40, UPF0061 protein FMP40, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FMP40Q08968 BCK1YJL095W 4437 nt2.52□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 MUD2YKL074C 1584 nt2.52□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 PHO2YDL106C 1680 nt2.51□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.51□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 SMB1YER029C 591 nt2.51□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YJR079WYJR079W 330 nt2.51□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 VPH2YKL119C 648 nt2.51□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 RPS1AYLR441C 768 nt2.51□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YML037CYML037C 1023 nt2.51□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YML108WYML108W 318 nt2.51□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 RPS7BYNL096C 573 nt2.51□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YPR177CYPR177C 372 nt2.51□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 BAS1YKR099W 2436 nt2.51□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 HAA1YPR008W 2085 nt2.51□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 ESL2YKR096W 3588 nt2.5□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 TRA1YHR099W 11235 nt2.5□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 BET3YKR068C 582 nt2.5□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 AIM29YKR074W 468 nt2.5□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.5□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YIL174WYIL174W 228 nt2.49□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 RPS22AYJL190C 393 nt2.49□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YJL202CYJL202C 348 nt2.49□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.49□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 RMP1YLR145W 606 nt2.49□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.49□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YHR078WYHR078W 1659 nt2.49□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YEF3YLR249W 3135 nt2.49□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 DNA2YHR164C 4569 nt2.49□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YFL019CYFL019C 354 nt2.48□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 TIM8YJR135W-A 264 nt2.48□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.48□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 RPS29AYLR388W 171 nt2.48□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YLR458WYLR458W 381 nt2.48□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.48□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 ICY1YMR195W 384 nt2.48□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 DGK1YOR311C 873 nt2.48□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 ATP15YPL271W 189 nt2.48□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 snR41snR41 95 nt2.48□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YPL150WYPL150W 2706 nt2.48□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 FAR11YNL127W 2862 nt2.47□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 BRO1YPL084W 2535 nt2.47□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 CSF1YLR087C 8877 nt2.47□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 PRP6YBR055C 2700 nt2.47□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 AAD16YFL057C 459 nt2.47□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.47□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YKL202WYKL202W 582 nt2.47□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.47□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YNL324WYNL324W 396 nt2.47□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 CRS5YOR031W 210 nt2.47□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YOR105WYOR105W 327 nt2.47□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YPR089WYPR089W 2667 nt2.47□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 VPS64YDR200C 1815 nt2.47□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 SSY1YDR160W 2559 nt2.47□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 RTT10YPL183C 3042 nt2.47□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 HRD3YLR207W 2502 nt2.46□□□□□ -2.01
FMP40Q08968 YKR078WYKR078W 1758 nt2.46□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 KRE33YNL132W 3171 nt2.46□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 NAB3YPL190C 2409 nt2.46□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 ECL1YGR146C 636 nt2.46□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 RPL40AYIL148W 387 nt2.46□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 RAM2YKL019W 951 nt2.46□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 PRE8YML092C 753 nt2.46□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 MGR1YCL044C 1254 nt2.46□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 snR54snR54 86 nt2.46□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 RNH70YGR276C 1662 nt2.46□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 SEC26YDR238C 2922 nt2.46□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 SIR3YLR442C 2937 nt2.46□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 GDS1YOR355W 1569 nt2.45□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 GET1YGL020C 708 nt2.45□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 YGR042WYGR042W 816 nt2.45□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 YGR050CYGR050C 357 nt2.45□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 RPC10YHR143W-A 213 nt2.45□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 JIP3YLR331C 378 nt2.45□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 EDS1YBR033W 2760 nt2.45□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 AXL1YPR122W 3627 nt2.45□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 KSP1YHR082C 3090 nt2.45□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 AMS1YGL156W 3252 nt2.44□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 RPO41YFL036W 4056 nt2.44□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 CCW14YLR390W-A 717 nt2.44□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 YOR248WYOR248W 303 nt2.44□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 GIN4YDR507C 3429 nt2.44□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 PES4YFR023W 1836 nt2.44□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 INP51YIL002C 2841 nt2.44□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 SWA2YDR320C 2007 nt2.44□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.43□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.43□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.43□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 AYT1YLL063C 1425 nt2.43□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.43□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.43□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 YKL111CYKL111C 336 nt2.43□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 YLR269CYLR269C 351 nt2.43□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 AIM32YML050W 936 nt2.43□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 SIP18YMR175W 240 nt2.43□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 PPN1YDR452W 2025 nt2.42□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 YPK1YKL126W 2043 nt2.42□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 SRO77YBL106C 3033 nt2.42□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 ACB1YGR037C 264 nt2.42□□□□□ -2.02
FMP40Q08968 YHR125WYHR125W 306 nt2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17 ms