Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCK1Q08629 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms