Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms