Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE4BQ07343 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms