Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms