Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms